余祥

長聘教軌副教授

  • 電話:021-34205134
  • 郵箱:yuxiang2021@sjtu.edu.cn
  • 地址✅👛:EON体育4閔行校區EON体育4平台4A-301
  • 博士生導師🥡,課題組組長👄。課題組研究方向包括植物RNA生物學和計算生物學。目前已在Developmental Cell🦻、Nature Communications、Plant Cell和Genome Research等期刊發表著作50余篇。

學術經歷

  • 2014年8月-2021年1月:  賓夕法尼亞大學生物系,分子生物學和生物信息學,博士後
  • 2008年9月-2014年7月: 中國科EON4分子植物科學卓越創新中心🙎,遺傳學,博士
  • 2004年9月-2008年6月: 華南農業大學,生物技術,學士

研究方向

組學數據分析: 開發程序對多組學數據進行整合分析

組學數據分析: 開發程序對多組學數據進行整合分析。

組學技術研發: 結合分子生物學和高通量測序技術研發新的...

組學技術研發: 結合分子生物學和高通量測序技術研發新的組學方法。

植物逆境生物學: 研究RNA轉錄後調控如何參與植物應對非生...

植物逆境生物學: 研究RNA轉錄後調控如何參與植物應對非生物脅迫。

RNA生物學: 研究RNA轉錄和轉錄後調控的分子機製

RNA生物學: 研究RNA轉錄和轉錄後調控的分子機製。

代表論著

  • •  

    Wu, Y., Shao, W., Yan, M., Wang, Y., Li, X., Gregory, B.D.,  Yang, J.*, Wang, H.* and  Yu X.* (2024). Transfer learning enables identification of multiple types of RNA modifications using nanopore direct RNA sequencing. Nature Communications 15, 4049.

    •  

    Xu, P., Wan, Q., Shao, W., Wu, Y., Wu, F., Li, X., Ren, W., He, Y., Li, S., and Yu, X. * (2025). Orchestration of leaf curvature by the SBP transcription factor SPL10–REVOLUTA module in Arabidopsis. JIPB, jipb.13893. 

    •  

    Zhang, J., Shao, W., Xu, Y., Tian, F., Chen, J., Wang, D., Lin, X., He, C., Yang, X., Staiger, D., Ding, Y., Yu, X.*, Xiao, J. * (2025). Unveiling the regulatory role of GRP7 in ABA signal-mediated mRNA translation efficiency regulation. Nat Commun 16, 3947.

    •  

    Zhang, Y.#, Xu, P.#, Xue, W.#, Zhu, W.*, Yu, X.* (2023). Diurnal gene oscillations modulated by RNA metabolism in tomato. The Plant Journal. tpj.16400. 

    •  

    Xu, P.#, Zhang, W.#, Wang, X., Zhu, Y., Liang, W., He, Y.*, Yu, X.* (2023). Multiomics analysis reveals a link between Brassica‐specific miR1885 and rapeseed tolerance to low temperature. Plant Cell & Environment. pce.14690. 

  • •  

    Wu, Y., Xu, P., Wang, L., Liu, S., Hou, Y., Lu, H., Hu, P.*, Li, X.*, and Yu, X.* (2025). scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis. Briefings in Bioinformatics 26, bbaf018. 

    •  

    Wu, Y., Shao, W., Liu, S., Wang, L., Xu, P., Zhang, X., Song, H., Li, X., Wang, J.*, and Yu, X.* (2025). Simultaneous profiling of ac4C and m5C modifications from nanopore direct RNA sequencing. International Journal of Biological Macromolecules, 140863. 

    •  

    Yu, X., Willmann, M.R., Vandivier, L.E., Trefely, S., Kramer, M.C., Shapiro, J., Guo, R., Lyons, E., Snyder, N.W., and Gregory, B.D*. (2021). Messenger RNA 5′ NAD+ Capping Is a Dynamic Regulatory Epitranscriptome Mark That Is Required for Proper Response to Abscisic Acid in Arabidopsis. Developmental Cell 56, 125-140.

    •  

    Yu, X. #, Davenport, J.W. #, Urtishak, K.A., Carillo, M.L., Gosai, S.J., Kolaris, C.P., Byl, J.A.W., Rappaport, E.F., Osheroff, N., Gregory, B.D.*, Felix, A.C.* (2017). Genome-wide TOP2A DNA cleavage is biased toward translocated and highly transcribed loci. Genome Research 27, 1238–1249.

    •  

    Yu, X.#, Willmann, M.R.#, Anderson, S.J., and Gregory, B.D. * (2016). Genome-Wide Mapping of Uncapped and Cleaved Transcripts Reveals a Role for the Nuclear mRNA Cap-Binding Complex in Cotranslational RNA Decay in Arabidopsis. Plant Cell 28, 2385–2397

教學情況

  • Python語言程序設計(本科生課程,BIO2551)🤾🏻‍♂️,主講,2023至今
  • 科技英語寫作與交流(研究生課程,GE7001)🎇,  主講,2024至今
  • 植物生物學 (研究生課程,BIO8203),參講⚇:2022-2023;主講:2024至今
  • 基因轉錄和表觀遺傳學 (研究生課程,BIO8508),2024至今

  • 2024.1-2027.12👃🏽:國家自然科學基金面上項目,主持,在研。
  • 2022.1-2025.12🩰:國家自然科學基金面上項目,主持,在研。
  • 2024.12-2025.12:上海市教委人工智能專項 ↗️,主持,在研。
  • 2021.10-2023.9📕:  上海市浦江人才項目,主持🥐,結題。

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
EON体育4平台专业提供🙇🏿‍♂️:EON体育4平台EON体育4🚶‍♂️🍒、EON体育4登录等服务,提供最新官网平台、地址、注册、登陆、登录、入口、全站、网站、网页、网址、娱乐、手机版、app、下载、欧洲杯、欧冠、nba、世界杯、英超等,界面美观优质完美,安全稳定,服务一流🎞,EON体育4平台欢迎您。 EON体育4平台官網xml地圖