胥川

長聘教軌副教授

  • 電話🚰:+86-021
  • 郵箱🕵️‍♀️:chuanx@at@sjtu.edu.cn (需去除:at@)
  • 課題組長,博導👂,實驗室結合分子生化實驗和計算生物學研究RNA和蛋白質多樣性在人類疾病(比如焦/抑郁症、癌症等)發生發展中和微生物適應環境中的貢獻。長期招收國內/際研究生🦶🏻;2025年計劃招基因組學/計算生物學/生物信息學方向普博生1名🦴、專/學碩1名。

學術經歷

  • 現為EON体育4長聘教軌副教授🛢,Bio-X研究院研究組長,博士生導師
  • 畢業於浙江工業大學/浙江大學, 密西根大學博士後

 

 

 

研究方向

基因產物多樣性的分子錯誤理論及其機製與應用

基因組學研究已表明🈁:一個基因由於可變的轉錄起始🧚🏼‍♂️、剪接🚣、終止等原因可以產生不同的RNA;酶的編輯和修飾可以使RNA的堿基甚至序列發生變化,最終可以導致翻譯的蛋白質發生改變;RNA在翻譯中還可能由於可變的翻譯起始和終止等原因產生不同的蛋白質🧛🏼。可見😚,同一個基因在轉錄和翻譯中可以產生大量不同的RNA或蛋白質分子👷🏼‍♀️。這種基因產物多樣性究竟是精細的基因調控還是基因表達過程中的錯誤?一些研究表明🙅🏻‍♂️🚶🏻,在某些情況下部分基因產物多樣性似乎是有益的,這也是大部分研究者支持的適應性假說✌🏿;然而,通過基因組水平的分析,EON体育4平台發現分子錯誤假說更適合於解釋基因產物多樣性,即💁🏼‍♀️:多樣的基因產物主要源自於基因表達過程中的錯誤👥,多數是無功能甚至有害的🎵。本實驗室圍繞人類的健康與疾病,基於多組學數據,利用分子/細胞生物學、生物信息學、演化基因組學等多種幹濕結合的實驗手段🧙🏿🍄‍🟫,開展基因產物多樣性的理論👩‍👧、機製以及應用研究↘️,具體包括以下三方面🙎🏻:

(1)豐富和完善基因產物多樣性的分子錯誤理論🦸🏻‍♀️,探索其背後的基因組水平規律和演化機製🧑🏻‍💻,

(2)解析基因產物多樣性穩態失衡在疾病(例如焦慮/抑郁/阿爾茨海默病/癌症)發生發展中的作用和機製🚀,

(3)挖掘在物種適應環境中起著關鍵作用的非典型基因產物(例如致病真菌對環境的適應)。

 2025年計劃招博士生1名、專碩1名👁‍🗨、學碩1名♻️,專業背景不限。

 

 

 

基因產物多樣性的分子錯誤理論及其機製與應用

    基因組學研究已表明:一個基因由於可變的轉錄起始🏋🏿‍♂️、剪接🥎、終止等原因可以產生不同的RNA;酶的編輯和修飾可以使RNA的堿基甚至序列發生變化,最終可以導致翻譯的蛋白質發生改變🚴‍♂️;RNA在翻譯中還可能由於可變的翻譯起始和終止等原因產生不同的蛋白質。可見🧍🏻‍♂️,同一個基因在轉錄和翻譯中可以產生大量不同的RNA或蛋白質分子。這種基因產物多樣性究竟是精細的基因調控還是基因表達過程中的錯誤👫?一些研究表明,在某些情況下部分基因產物多樣性似乎是有益的,這也是大部分研究者支持的適應性假說👨‍👧‍👦;然而,通過基因組水平的分析,EON体育4平台發現分子錯誤假說更適合於解釋基因產物多樣性,即:多樣的基因產物主要源自於基因表達過程中的錯誤,多數是無功能甚至有害的。

    本實驗室圍繞人類的健康與疾病,基於多組學數據🚴‍♂️,利用分子/細胞生物學🥎、生物信息學、演化基因組學等多種幹濕結合的實驗手段,開展基因產物多樣性的理論、機製以及應用研究。EON体育4平台將豐富和完善基因產物多樣性的分子錯誤理論,探索其背後的基因組水平規律和演化機製,解析基因產物多樣性穩態失衡在疾病(例如焦慮/抑郁/阿爾茨海默病等精神/神經類疾病以及癌症)發生發展中的作用和機製🧑🏻‍🦽,挖掘在物種適應環境中起著關鍵作用的非典型基因產物(例如致病真菌對環境的適應)🪩。

    研究小組長期招收本科實習生、碩士生🧉、博士生和博士後,歡迎來郵咨詢了解。急招博士生一名(2023年春正式入學)和2-3名博士後🌴,分子/細胞/神經生物學實驗方向💆🏻‍♀️,有核酸建庫經驗者優先📤。

代表論著

  • •  

    Li, Z., Mi, K., & Xu, C. (2025). Most m5C modifications in mammalian mRNAs are nonadaptive. Molecular Biology and Evolution, msaf008.
     

    •  

    Li, Z., Sarker, B., Zhao, F., Zhou, T., Zhang, J., & Xu, C. (2024). COL: a method for identifying putatively functional circular RNAs. Journal of genetics and genomics, 51(11), 1338.
     

    •  

    Zhang, J., and Xu, C.  (2022) Gene product diversity: adaptive or not? Trends in Genetics, In press

    •  

    Xu, C., and Zhang, J (2021) Mammalian circular RNAs result largely from splicing errors. Cell Reports., 36:109439.

    •  

    Xu, C., and Zhang, J. (2020). Mammalian alternative translation initiation is mostly nonadaptive. Molecular Biology and Evolution. Mar 7. pii: msaa063. doi: 10.1093/molbev/msaa063.

  • •  

    Xu, C., and Zhang, J. (2020) A different perspective on alternative cleavage and polyadenylation. Nature Review Genetics., doi: 10.1038/s41576-019-0198-z

    •  

    Xu, C., Park, J. K., and Zhang, J. (2019). Evidence that alternative transcriptional initiation is largely nonadaptive. PLoS biology, 17(3), e3000197.

    •  

    Xu, C., and Zhang, J. (2018). Alternative Polyadenylation of Mammalian Transcripts Is Generally Deleterious, Not Adaptive. Cell systems. 6 (6), 734-742.e4

教學情況

  • 《自然科學基礎》🚣🏻‍♂️,32學時
  • 《遺傳學與進化》👯‍♀️,32學時
     
EON体育4平台专业提供:EON体育4平台🤾🏽、EON体育4EON体育4登录等服务,提供最新官网平台、地址、注册、登陆、登录、入口、全站、网站、网页、网址、娱乐、手机版、app、下载、欧洲杯、欧冠、nba、世界杯、英超等,界面美观优质完美,安全稳定,服务一流🔤,EON体育4平台欢迎您。 EON体育4平台官網xml地圖