李雷

長聘教軌副教授

  • 電話:+86 021
  • 郵箱:lei.li@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市閔行區張家裏路360號
  • 博士生導師,合成微生物藥物課題組組長,國家優秀青年基金(海外)獲得者。主要從事微生物天然藥物化學與合成生物學研究。已在Nat Microbiol等期刊發表20余篇論文🧖🏿‍♂️。擔任JIMB🎧、mLife與iMeta(青年)編委🧑🏿‍🏭。常年歡迎不同學科背景的本科生🙍‍♂️、研究生與博士後等加盟。

學術經歷

  • 2022年7月-今,EON体育4平台🏄‍♀️🙋,長聘教軌副教授
  • 2019年5月-2022年5月✳️,美國洛克菲勒大學👩‍🍼,博士後(合作導師:Sean Brady 教授)
  • 2017年7月-2019年4月👩‍🎨,中國科EON4分子植物科學卓越創新中心,博士後(合作導師🫏:姜衛紅 研究員)
  • 2011年9月-2017年7月📖,中國科EON4分子植物科學卓越創新中心👩🏿‍💻👩🏼‍🔧,微生物學,理學博士
  • 2007年9月-2011年6月,四川農業大學生命科學EON4,生物科學,理學學士

研究方向

新型合成生物技術驅動的微生物藥物高效製造

由於甲基化限製修飾導致低的DNA轉化效率以及菌株本身弱的同源重組能力👮🏻‍♀️🌑,導致多種重要藥物產生菌遺傳操作困難,嚴重製約了工業高產菌株的構建。本實驗將主要聚焦難操作藥源微生物👾,包括稀有放線菌與絲狀真菌等,發展系列普適的新一代合成生物技術,以此開發具有“發酵水平高、組分簡單、菌種穩定”等特點的新一代工業菌株🧧。隨後與藥企合作優化發酵工藝,完成小試與中試研究,降低工業生產成本與有機溶劑使用率,最終實現多種微生物藥物或藥物中間體高效製造🐸。

微生物天然產物大規模基因組定向挖掘與活性評價

大規模測序的微生物基因組為新化合物挖掘提供了一個巨大寶庫🧙🏼‍♀️。核心問題是如何選擇感興趣的基因簇並將其快速轉變為目標產物。本實驗室將主要聚焦非核糖體肽合成基因簇高通量定向挖掘,通過基因簇體內高效表達與結構預測指導的化學合成等策略,快速獲得新結構或新機製化合物。隨後開展體外活性、細胞毒性、作用機製與小鼠疾病模型等研究。最後與醫院合作,完成臨床前研發,推進新藥臨床研究🫲🏿。

代表論著

  • •  

    Zhang F#, Zhang F#, Yu XC#, Sun RZ, Wu YZ, Zhou YW, Li L*. Discovery of a novel family of Gram-negative-active cationic cyclolipopeptides by motif search-guided chemical synthesis. CCS Chemistry 2024; doi: 10.31635/ccschem.024.202404925.

    •  

    Sun RZ#, Zhao D#, Yu XC#, Zhang F, You RX, Luo XX, Li L*. Discovery of a family of menaquinone-targeting cyclic lipodepsipeptides for multidrug-resistant Gram-positive pathogens. Communications Biology 2024; 7:1453. 

    •  

    Sun RZ, You RX, Yu XC, Zhao D, Li L*. Discovery and synthesis of a Gram-negative-active cationic lipopeptide antibiotic inspired by primary sequences from underexplored Gram-negative bacteria. Organic Letters 2024; 26:1348-1352.

    •  

    Li L*. Accessing hidden microbial biosynthetic potential from underexplored sources for novel drug discovery. Biotechnology Advances 2023; 66:108176.

    •  

    Li L, Koirala B, Hernandez Y, MacIntyre LW, Russo R, Ternei MA, Brady SF*. Identification of structurally diverse menaquinone-binding antibiotics with in vivo activity against multidrug-resistant pathogens. Nature Microbiology 2022; 7:120-131.

  • •  

    Li L, Wei KK, Liu XC, Wu YJ, Zheng GS, Chen SX, Jiang WH*, Lu YH*. aMSGE: advanced multiplex site-specific genome engineering with orthogonal modular recombinases in actinomycetes. Metabolic Engineering 2019; 52:153-167.

    •  

    Li L, Liu XC, Wei KK, Lu YH*, Jiang WH*. Synthetic biology approaches for chromosomal integration of genes and pathways in industrial microbial systems. Biotechnology Advances 2019; 37(5):730-745.

    •  

    Li L, Zheng GS, Chen J, Ge M, Jiang WH*, Lu YH*. Multiplexed site-specific genome engineering for overproducing bioactive secondary metabolites in actinomycetes. Metabolic Engineering 2017; 40:80-92.

    •  

    Li L, Jiang WH*, Lu YH*. New strategies and approaches for engineering biosynthetic gene clusters of microbial natural products. Biotechnology Advances 2017; 35:936-949.

    •  

    Li L, Zhao YW, Ruan LJ, Yang S, Ge M, Jiang WH*, Lu YH*. A stepwise increase in pristinamycin II biosynthesis by Streptomyces pristinaespiralis through combinatorial metabolic engineering. Metabolic Engineering 2015; 29:12-25.

獲獎情況

  • 國家優秀青年科學基金(海外)獲得者(2023)

  • 上海市海外高層次人才引進計劃(2023)

  • 上海市浦江人才計劃(2022)

  • 國家博士後創新人才支持計劃(2017)

  • 中國科EON4大學優秀畢業生(2017)

  • 中國科EON4院長優秀獎(2017)

教學情況

  • 本科生必修課  普通生物學
  • 上海市合成生物學重大專項(2024-2028,子課題主持)
  • 國家自然科學基金面上項目(2024-2027,主持)
  • 國家重點研發計劃合成生物學重點專項(2023-2028,課題主持)
  • 國家重點研發計劃合成生物學青年重點專項(2023-2028👨🏼‍💻👩‍👧,任務主持)
  • 中央高校優秀青年團隊項目(2023-2026🙂,課題主持)
  • 上海市自然科學基金探索類項目(2018-2021🧉,主持)
  • 中國博士後科學基金面上項目(2017-2018,主持)

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
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