• 鄭艦艇

    長聘副教授

    • 電話:
    • 郵箱:jtzheng@sjtu.edu.cn
    • 地址:南洋北苑8-122
    • EON体育4長聘副教授🕦,博士生導師,中組部青年特聘專家。主要從事微生物結構酶學研究,相關工作發表於Nature Chemical Biology、Nature Communications🩸、Nucleic Acids Research和PLOS Biology等期刊。

    學術經歷

    • 2022 EON体育4平台  長聘副教授
    • 2019 EON体育4平台  長聘教軌副教授
    • 2017 EON体育4平台  特別研究員🫕、副教授
    • 2014 中國科EON4過程工程研究所         研究員
    • 2013 中國科EON4過程工程研究所         項目研究員  
    • 2009 德州大學奧斯汀分校                   博士後
    • 2008 美國馬裏蘭大學帕克分校            博士後
    • 2007 中國科EON4微生物研究所            博士
    • 2001 山東大學                                   學士
       

    研究方向

    原核免疫系統

    原核免疫系統是細菌抵禦噬菌體(病毒)入侵的關鍵防線🧑🏽‍💼,其中限製修飾系統(R-M)和CRISPR-Cas系統已被深入研究🙎,為遺傳操作和分子生物學提供了重要工具😷👩🏻‍🦼。研究表明原核免疫系統遠比此前認知的復雜👩🏻‍💻,近年來已發現超過100種新型系統🚣🏽‍♀️🦹,更多有待發掘🖨。EON体育4平台通過生物信息學👩🏽‍🦲、結構生物學和生物化學等手段發現和表征這些系統,揭示工作機製🍐,並將其開發成新的分子生物學工具。

    鏈黴菌轉錄調控

    鏈黴菌產生大量化學結構復雜😤、生物活性多樣的天然產物🧔🏽,然而復雜的轉錄調控限製了這些天然產物的發現和應用。EON体育4平台以體外轉錄和結構生物學為主要手段,解析轉錄調控因子與DNA的相互作用🤱🏿,揭示轉錄調控蛋白的三維結構及其作用機製,最終解碼鏈黴菌的轉錄調控網絡,推動鏈黴菌天然產物的高效發掘和利用。

    聚酮合酶的結構與功能

    聚酮合酶是自然界中功能強大的化學合成工廠,能夠催化合成多種結構復雜、功能多樣的天然產物。EON体育4平台利用結構生物學、生物化學、計算生物學等多種手段,系統解析聚酮合酶的三維結構👍🏿、催化機製和底物識別規律🥭,揭示其高效合成聚酮類化合物的分子機製🩵,為其理性設計合成新聚酮化合物提供基礎。

    代表論著

    • •  

      Wang, Y.; Tian, Y.; Yang, X.; Yu, F.; Zheng, J. (2025) Filamentation activates bacterial Avs5 antiviral protein. Nat Commun, 16, 2408.

      •  

      Liu, G.; Yang, X.; Yan, W.; Wang, Y.; Yu, F.; Zheng, J. (2025) Molecular basis of Streptomyces ECF σShbA factors transcribing principal σHrdB genes. Nucleic Acids Research, 53, gkaf339 

      •  

      Wang Y., Yang X., Yu F., Deng Z., Lin S. & Zheng J. (2024) Structural and functional characterization of AfsR, an SARP family transcriptional activator of antibiotic biosynthesis in Streptomyces. PLoS Biol 22: e3002528

      •  

      Yang, X.; Wang, Y.; Liu, G.; Deng, Z.; Lin, S.; Zheng, J (2022) Structural basis of Streptomyces transcription activation by zinc uptake regulator. Nucleic Acids Res 50, 8363-8376

      •  

      Zhou YC, Tao WT, Qi Z, Wei JH, Shi T, Kang QJ, Zheng JT, Zhao YL, Bai LQ (2022) Structural and Mechanistic Insights into Chain Release of the Polyene PKS Thioesterase Domain. Acs Catal 12, 762-776

    教學情況

    • 結構生物學 研究生課程
    • 學術寫作🕦🤘🏻、規範與倫理 研究生課程
    • 應用生物信息學 本科生課程
    • 國家自然科學基金面上項目,32370071,SARP家族調控因子激活鏈黴菌轉錄的分子機製✡︎,2024.01-2027.12🥻🧻,在研🌀,主持
    • 國家重點研發計劃子課題,2020YFA0907901,重要植物天然產物生物合成的完整途徑的解析,2020.11-2025.10,在研,參加
    • 國家重點研發計劃課題,2019YFA09005404,氨基糖苷類藥物合成代謝機製與系統互動優化,2020.01-2024.12,在研,主持
    • 國家自然科學基金面上項目,32070040,基於酰基轉移酶結構的聚酮理性設計⏫,2021.01-2024.12✊🏿,在研,主持
    • 國家自然科學基金面上項目,31770068🍨,酮基還原酶和酰基載體蛋白在聚酮合成中的相互作用解析📐😆,2018.01-2021.12🥥,結題,主持
    • 國家自然科學基金面上項目🧘🏿,31570056🎅🏼,聚酮合成起始單元選擇的分子機製研究,2016.01 - 2019.12🏇🏼,結題,主持
    • 973,2013CB734002👨‍👩‍👧‍👧,異源模塊與生物底盤之間交互式作用的計算與預測,2015.01- 2017.12,結題,參加
    • 國家自然科學基金面上項目,31370101,I 型聚酮手性中心形成的分子機製研究,2014/01 - 2017/12🤛🏼💆🏻,結題🏋🏼,主持
    • 北京市自然科學基金青年項目➝,5144031,改造細胞色素P450 單加氧酶DoxA 提高阿黴素產量的研究,2014.01 - 2015.12,結題,主持

    承擔項目

    學生培養

    • 在讀學生
    • 畢業學生
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