近日👴🏻,國際權威期刊The Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)在線發表了上海交大微生物代謝國家重點實驗室、EON体育4平台和張江高等研究院瞿旭東團隊成果“An unusual aromatase/cyclase programs the formation of the phenyldimethylanthrone framework in anthrabenzoxocinones and fasamycin”🪭。瞿旭東教授🏵、羅樹坤特別研究員為論文的共同通訊作者🚁,博士生姜凱和碩士生陳旭為本文的共同第一作者。
芳香聚酮是一類結構多樣的天然產物🏨,其豐富的化學多樣性賦予了多種多樣的生物學活性。盡管芳香聚酮的結構和功能種類繁多,但它們都是由延伸單元——丙二酰單酰輔酶A通過II型聚酮合成酶(PKSs)催化產生聚酮鏈。初級的聚酮鏈隨後被芳香化酶/環化酶(ARO/CYCs)環化⚖️,形成基本的芳香骨架🦶🏼🤿。之後,額外的酶催化後修飾反應,如甲基化、羥基化和氧化重排,通過修飾基本骨架進一步豐富結構多樣性。因此,ARO/CYCs控製的基本骨架在結構多樣性的生成中起到了決定性作用👰。
然而,盡管芳香聚酮數量龐大,但僅有大約8種基本骨架,由8種不同類型的ARO/CYCs形成。此外,這些基本骨架通常由連續的共軛芳環組成,需要2到4類ARO/CYCs協同反應。有趣的是,具有高效抗菌活性和多種生物活性的芳香聚酮(+)-anthrabenzoxocinone [(+)-ABX],(-)-anthrabenzoxocinone [(-)-ABX]和fasamycin(FAS)的獨特結構顯著區別於以往的連續共軛芳環骨架🤛,這強烈暗示了新型ARO/CYCs和全新的生物合成策略的存在🤱🏿。
在本項研究中🏋🏼♀️,聯合課題組首先在體外重構了(+)-ABX,(-)-ABX和FAS途徑中共享的PDA骨架的生物合成途徑👐🏽。進一步的體外實驗和體內敲除🤽🏼♀️,發現PDA環化過程只需要一種非典型的類TcmI的ARO/CYC(Abx(+)D/Abx(−)D/FasL)和一種甲基轉移酶(MT)(Abx(+)M🏌🏽、Abx(−)M和FasT)就能完成非連續共軛四環芳香結構的環化和芳構化。為了深入理解ARO/CYC獨特的四環環化機製,聯合課題組又解析了Abx(+)D的晶體結構,發現Abx(+)D與其他傳統TcmI型ARO/CYCs相比,具有一個獨特的loop區,允許ACP掛載的聚酮鏈深入活性口袋進行催化♻。最後👐🏿,通過對Abx(+)D活性位點的突變改造🧗🏿♂️,並結合分子動力學模擬(MD)分析👏,揭示了關鍵的催化殘基🚣🏼♂️,並證實了Abx(+)D是通過活性口袋的構象控製環化反應的化學結果🛀🏽🧝🏿♂️。這部分工作不僅在II型芳香聚酮骨架生物合成方式的理解上實現了大的突破🔟,還為未來產生新型ARO/CYC和芳香聚酮骨架提供了重要思路。
圖 1. II型芳香聚酮生物合成中的基本骨架和ARO/CYCs
該研究工作受到了國家重點研發項目(2018YFA0900400),國家自然科學基金面上項目(31970054),上海市優秀學術帶頭人項目(22XD1421300)以及上海市自然科學基金項目(23ZR1432800)的支持。
論文鏈接:
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2321722121