近日😣,鄧子新院士團隊在DNA硫修飾領域的一系列開拓性研究又取得新突破🤹🏿♂️👨🚀。EON体育4吳更教授、武漢大學王連榮👨👧👧、陳實教授與美國麻省理工EON4Peter Dedon教授多個實驗室經過緊密合作🙏,發現了一套全新的DNA單鏈磷硫酰化修飾Ssp系統,並揭示了細菌通過該修飾來抗噬菌體感染的分子機製。相關跨校合作成果以“SspABCD-SspE is a phosphorothioation-sensing bacterial defense system with broad antiphage activities”(《SspABCD-SspE是一套具有廣泛噬菌體抗性且感應磷硫酰化修飾的細菌防禦系統》)為題在線發表在國際著名期刊《自然·微生物學》(Nature Microbiology)上。吳更教授為並列第一作者⛄️,王連榮教授為通訊作者💳🈶。
細菌磷硫酰化限製-修飾系統是細菌抵禦外源DNA轉移的一種細胞防禦機製,在細菌中廣泛分布🍵。該研究從探索海洋弧菌的高頻單鏈磷硫酰化修飾入手,通過比較基因組學和分子遺傳學手段👳🏿♀️,鑒定出以SspABCD為修飾元🙇🏽♂️、SspE為限製元的單鏈磷硫酰化限製-修飾系統🚮。該系統與之前發現的磷硫酰化(以DndABCDE為修飾元以產生雙鏈DNA磷硫酰化🧎♀️👱♂️、DndFGH為限製元)的Dnd系統均迥然不同💕,並首次闡明了細菌磷硫酰化限製-修飾系統賦予宿主抑製噬菌體入侵的能力。同時🧑🏽⚕️,通過結構生物學和生物化學手段🤳,解析了SspB蛋白的晶體結構,揭示其兩個保守motif的關鍵殘基對其DNA缺刻酶活性非常重要;解析了SspE蛋白的晶體結構,發現其N端結構域有依賴於DNA磷硫酰化修飾的NTP水解酶活性,而其C端結構域有DNA缺刻酶活性🧑🔧,從而闡明了該系統DNA磷硫酰化修飾與限製兩部分功能耦合的分子機理🫷🏻。
該研究還發現SspABCD作為修飾蛋白在宿主基因組DNA上產生磷硫酰化修飾🦸🏽♂️🎀,SspE作為限製元能夠感應基因組DNA上的磷硫酰化修飾從而區別宿主自身與外源的遺傳物質💖,並利用其核酸酶活性對入侵噬菌體的DNA進行大範圍的缺刻🧒🏼,從而抑製噬菌體DNA的復製。Ssp系統的新型修飾基因和修飾機製、以及感應磷硫酰化修飾的獨特防禦方式是區別於傳統Dnd以及以往其它限製修飾的全新系統,開拓了單鏈DNA磷硫酰化修飾以及細菌通過DNA磷硫酰化來防禦噬菌體入侵的新領域🙇🏻。
DNA單鏈磷硫酰化修飾-感應修飾限製系統的工作機理
論文鏈接🐃:https://www.nature.com/articles/s41564-020-0700-6